Cílem na poli monitoringu a výzkumu je:
- koordinovat monitoring a výzkum externích pracovišť
- poskytovat podporu externímu monitoringu a výzkumu a podílet se na nich do té míry, aby výsledky získané tímto výzkumem a monitoringem mohly být efektivně využívány Správou NP
- řešit vlastní úkoly na poli monitoringu a výzkumu, jejichž výsledky jsou důležitým podkladem pro péči o národní park, a to zejména „provádět potřebné inventarizační přírodovědné průzkumy, dokumentaci a šetření v ochraně přírody“ (§ 78, odst. 7 zákona č. 114/1992 Sb.).
Hlavní směry výzkumu:
1. Komplexní monitoring stavu a vývoje přírodního prostředí (neživé i živé přírody), který je zaměřen na následující tématické oblasti:
- oblast geologie, geochemie, hydrologie a hydrogeologie
- oblast geodynamických a klimatických jevů
- oblast biologie
- oblast vývoje lesních ekosystémů
- oblast turistického ruchu
Součástí je monitoring předmětu ochrany, jímž je „ochrana reprezentativní ukázky pískovcového fenoménu české křídové pánve“ a v neposlední řadě monitoring přírodních fenoménů, které jsou předmětem ochrany v EVL České Švýcarsko, resp. PO Labské pískovce (ve spolupráci s Agenturou ochrany přírody a krajiny ČR).
2. Systematická dokumentace živé a neživé přírody, v úzké spolupráci se Správou NP Saské Švýcarsko a Správou CHKO Labské pískovce. Cílem dokumentace živé a neživé přírody je získat ucelená data o živé i neživé přírodě národního parku, a to na základě cíleného systematického průzkumu a v rámci možností na základě jednotné metodiky a v rámci celého přeshraničního celku Českosaského Švýcarska. Data získaná dokumentací živé i neživé přírody představují významný podklad pro stanovení odpovídajícího managementu a pro výkon státní správy.
3. Aktuální, pro NP České Švýcarsko specifická témata, která reagují na aktuální problémy ochrany přírody a krajiny na území národního parku. Mezi tato témata náleží např. riziko skalního řícení, invaze borovice vejmutovky do přirozených společenstev, vývoj plochy požářiště v Jetřichovicích, dopady turistiky na ekosystémy aj.
4. Monitoring prováděných managementových opatření pro optimalizaci managementových opatření na území národního parku.
